Trilium

AFFiNE 将文档、无边画布、表格数据库、知识库和规划放在同一个工作区中，让文字、便签、网页、页面链接、图形与幻灯片可以共同编排。它采用本地优先的数据方式，同时支持跨平台客户端、实时同步与协作，也可自行托管社区版。可选 AI 功能还能把内容转为报告、幻灯片或思维导图，适合希望减少多款知识工具切换的人。

思源笔记以内容块、双向链接和所见即所得 Markdown 编辑器组织个人知识，可把引用、查询、PDF 标注和任务放进同一工作空间。它提供桌面与移动应用，也能通过 Docker 自托管，并支持导出 Markdown、PDF、Word 和 HTML，适合重视本地数据控制的用户。

Logseq 用 Markdown 或 Org-mode 笔记、双向链接和知识图谱帮助用户整理想法，也包含任务管理、PDF 标注以及插件和主题生态。桌面与移动端均可使用；新的数据库图谱处于测试阶段，实时协作和新移动端仍为早期版本，重要资料不宜在缺少备份时直接迁移。

Tolaria 是跨 macOS、Windows 和 Linux 的桌面知识库工具，用于整理个人笔记、团队文档或智能体记忆。笔记保持为带 YAML 元数据的 Markdown 文件，每个知识库也是 Git 仓库，可离线使用并保留版本历史，不依赖 Tolaria 账号、订阅或云服务。